MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Helicobacter pylori Gambia94/24 chromosome

Total Repeats: 30572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017371	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	385218267
2	NC_017371	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218267
3	NC_017371	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	385218267
4	NC_017371	TTCT	2	8	259	266	0 %	75 %	0 %	25 %	385218267
5	NC_017371	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218267
6	NC_017371	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	385218267
7	NC_017371	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	385218267
8	NC_017371	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218267
9	NC_017371	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218267
10	NC_017371	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	385218267
11	NC_017371	CAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218268
12	NC_017371	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	385218268
13	NC_017371	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218268
14	NC_017371	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218268
15	NC_017371	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	385218268
16	NC_017371	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218268
17	NC_017371	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	385218268
18	NC_017371	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218268
19	NC_017371	TTGTAA	2	12	867	878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385218268
20	NC_017371	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	385218269
21	NC_017371	TCA	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218269
22	NC_017371	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385218269
23	NC_017371	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218269
24	NC_017371	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	385218269
25	NC_017371	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	385218269
26	NC_017371	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	385218269
27	NC_017371	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218269
28	NC_017371	GCTT	2	8	1455	1462	0 %	50 %	25 %	25 %	385218269
29	NC_017371	GCA	2	6	1520	1525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218269
30	NC_017371	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218269
31	NC_017371	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218269
32	NC_017371	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218269
33	NC_017371	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218270
34	NC_017371	A	7	7	1776	1782	100 %	0 %	0 %	0 %	385218270
35	NC_017371	ATTATA	2	12	1794	1805	50 %	50 %	0 %	0 %	385218270
36	NC_017371	CCTG	2	8	1809	1816	0 %	25 %	25 %	50 %	385218270
37	NC_017371	CCAA	2	8	1833	1840	50 %	0 %	0 %	50 %	385218270
38	NC_017371	TCA	2	6	1859	1864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218270
39	NC_017371	TGAA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	25 %	0 %	385218270
40	NC_017371	GTT	2	6	1896	1901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218270
41	NC_017371	TTC	2	6	1983	1988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218270
42	NC_017371	TGG	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218270
43	NC_017371	TCA	2	6	2050	2055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218270
44	NC_017371	AATG	2	8	2063	2070	50 %	25 %	25 %	0 %	385218270
45	NC_017371	G	6	6	2188	2193	0 %	0 %	100 %	0 %	385218270
46	NC_017371	ATTC	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	385218270
47	NC_017371	TG	3	6	2520	2525	0 %	50 %	50 %	0 %	385218271
48	NC_017371	A	8	8	2541	2548	100 %	0 %	0 %	0 %	385218271
49	NC_017371	CTTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	385218271
50	NC_017371	T	6	6	2638	2643	0 %	100 %	0 %	0 %	385218271
51	NC_017371	TGA	2	6	2662	2667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218271
52	NC_017371	T	7	7	2679	2685	0 %	100 %	0 %	0 %	385218271
53	NC_017371	AGC	2	6	2777	2782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218271
54	NC_017371	A	6	6	2828	2833	100 %	0 %	0 %	0 %	385218271
55	NC_017371	GTG	2	6	2966	2971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218271
56	NC_017371	T	6	6	3019	3024	0 %	100 %	0 %	0 %	385218271
57	NC_017371	AGA	2	6	3064	3069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218271
58	NC_017371	CAAA	2	8	3100	3107	75 %	0 %	0 %	25 %	385218271
59	NC_017371	GTG	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218271
60	NC_017371	GCC	2	6	3132	3137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385218271
61	NC_017371	A	7	7	3247	3253	100 %	0 %	0 %	0 %	385218272
62	NC_017371	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	385218272
63	NC_017371	TG	3	6	3428	3433	0 %	50 %	50 %	0 %	385218272
64	NC_017371	GTT	2	6	3577	3582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218272
65	NC_017371	ATC	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218272
66	NC_017371	GAT	3	9	3727	3735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218272
67	NC_017371	GCA	2	6	3772	3777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218272
68	NC_017371	GAAA	2	8	3778	3785	75 %	0 %	25 %	0 %	385218272
69	NC_017371	CAG	2	6	3823	3828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218272
70	NC_017371	ATAG	2	8	3832	3839	50 %	25 %	25 %	0 %	385218272
71	NC_017371	A	6	6	3865	3870	100 %	0 %	0 %	0 %	385218272
72	NC_017371	A	6	6	3888	3893	100 %	0 %	0 %	0 %	385218272
73	NC_017371	ATT	2	6	3905	3910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218272
74	NC_017371	GGC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218272
75	NC_017371	AG	3	6	5124	5129	50 %	0 %	50 %	0 %	385218273
76	NC_017371	A	6	6	5133	5138	100 %	0 %	0 %	0 %	385218273
77	NC_017371	AAAG	2	8	5149	5156	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
78	NC_017371	AAAG	2	8	5164	5171	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
79	NC_017371	AAAG	2	8	5179	5186	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
80	NC_017371	AAAG	2	8	5194	5201	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
81	NC_017371	AAAG	2	8	5209	5216	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
82	NC_017371	AAAG	2	8	5224	5231	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
83	NC_017371	AAAG	2	8	5239	5246	75 %	0 %	25 %	0 %	385218273
84	NC_017371	A	6	6	5268	5273	100 %	0 %	0 %	0 %	385218273
85	NC_017371	TCGC	2	8	5623	5630	0 %	25 %	25 %	50 %	385218274
86	NC_017371	ATT	2	6	5718	5723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385218274
87	NC_017371	TGG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218274
88	NC_017371	A	6	6	5928	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	385218274
89	NC_017371	CTT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218274
90	NC_017371	T	6	6	5960	5965	0 %	100 %	0 %	0 %	385218274
91	NC_017371	A	6	6	5970	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	385218274
92	NC_017371	TTGT	2	8	5976	5983	0 %	75 %	25 %	0 %	385218274
93	NC_017371	GTT	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
94	NC_017371	TAA	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218274
95	NC_017371	GTG	2	6	6214	6219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385218274
96	NC_017371	GC	3	6	6276	6281	0 %	0 %	50 %	50 %	385218274
97	NC_017371	CAA	2	6	6282	6287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385218274
98	NC_017371	TGT	2	6	6335	6340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
99	NC_017371	C	6	6	6380	6385	0 %	0 %	0 %	100 %	385218274
100	NC_017371	GTT	2	6	6390	6395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
101	NC_017371	TCA	2	6	6406	6411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218274
102	NC_017371	TTGAT	2	10	6490	6499	20 %	60 %	20 %	0 %	385218274
103	NC_017371	CGCTTG	2	12	6519	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218274
104	NC_017371	GCG	2	6	6593	6598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385218274
105	NC_017371	TTGCT	2	10	6607	6616	0 %	60 %	20 %	20 %	385218274
106	NC_017371	CGA	2	6	6638	6643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218274
107	NC_017371	AC	3	6	6702	6707	50 %	0 %	0 %	50 %	385218274
108	NC_017371	GC	3	6	6734	6739	0 %	0 %	50 %	50 %	385218274
109	NC_017371	CTT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218274
110	NC_017371	GTT	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
111	NC_017371	TAG	5	15	6842	6856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218274
112	NC_017371	TAC	2	6	6863	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218274
113	NC_017371	GTT	2	6	6886	6891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
114	NC_017371	GTT	2	6	6978	6983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
115	NC_017371	GTT	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
116	NC_017371	TGC	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218274
117	NC_017371	GCA	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385218274
118	NC_017371	ATCG	2	8	7248	7255	25 %	25 %	25 %	25 %	385218274
119	NC_017371	GCT	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385218274
120	NC_017371	CGTT	2	8	7283	7290	0 %	50 %	25 %	25 %	385218274
121	NC_017371	GTT	2	6	7305	7310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385218274
122	NC_017371	A	6	6	7422	7427	100 %	0 %	0 %	0 %	385218274
123	NC_017371	GA	10	20	7461	7480	50 %	0 %	50 %	0 %	385218274
124	NC_017371	TTTTA	2	10	7670	7679	20 %	80 %	0 %	0 %	385218275
125	NC_017371	T	6	6	7718	7723	0 %	100 %	0 %	0 %	385218275
126	NC_017371	C	7	7	7767	7773	0 %	0 %	0 %	100 %	385218275
127	NC_017371	AGA	2	6	7789	7794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218275
128	NC_017371	CAT	2	6	7836	7841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218276
129	NC_017371	GCC	2	6	7842	7847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385218276
130	NC_017371	TCT	2	6	7903	7908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218276
131	NC_017371	GAAACC	2	12	7951	7962	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385218276
132	NC_017371	AAT	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385218276
133	NC_017371	CTT	2	6	8009	8014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385218276
134	NC_017371	CAT	2	6	8099	8104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218276
135	NC_017371	GC	3	6	8146	8151	0 %	0 %	50 %	50 %	385218276
136	NC_017371	ATG	2	6	8152	8157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385218276
137	NC_017371	TCA	2	6	8176	8181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385218276
138	NC_017371	CG	3	6	8211	8216	0 %	0 %	50 %	50 %	385218276
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407	NC_017371	AAG	2	6	22742	22747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385218288
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491	NC_017371	AG	3	6	28345	28350	50 %	0 %	50 %	0 %	385218292
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500	NC_017371	GCTGG	2	10	28763	28772	0 %	20 %	60 %	20 %	385218292

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